云南省7县市齐氏姬鼠种群遗传差异分析

作者：李玉琼; 高子厚^*; 段兴德; 杜春红; 刘正祥; 邵宗体; 苏超; 浦恩念

来源：现代预防医学, 2019, 46(17): 3171-3176.

• 齐氏姬鼠
• 细胞色素b基因
• 地理种群
• 遗传分化

目的基于细胞色素b(Cyt b)基因的全序列,分析云南齐氏姬鼠不同地理种群的遗传多样性和遗传分化。方法采集玉龙、剑川、宜良等7地的齐氏姬鼠,提取基因组DNA,使用通用引物L14724和H15915R扩增,并测序。运用ClustalX软件、Mega 6.0软件、Dnasp5.0软件、Arlequin 3.1软件对细胞色素b(Cyt b)基因结构特征进行比较分析。结果获得1110 bp的齐氏姬鼠Cyt b基因序列44条。转换和颠换(TS/TV)比为6.957,A+T含量(59.47%)大于G+C含量(40.53%)。共发现51个变异位点,定义了29个单倍型,其中种群间有一个单倍型(Hap19)为德钦和维西种群共享,齐氏姬鼠单倍型多样性为0.965,核苷酸多样性为0.00758。AMOVA分子变异分析结果表明,种群内的遗传差异(68.20%)明显高于种群间的遗传差异(31.80%)。Fst统计结果显示,玉龙、宜良、昭通、剑川4个种群分别与德钦、维西、贡山3个种群间遗传差异显著(贡山与宜良种群除外)。结论云南不同地理种群的齐氏姬鼠存在遗传分化,其遗传结构较为复杂,有待进一步研究其种群遗传多样性与地理之间的关系。

• 单位
  云南省地方病防治所