应用寡核苷酸芯片技术探索原发性肝细胞癌发生发展中的差异表达基因

作者：刘秀峰; 施瑞华; 郜恒骏; 朱宏; 秦叔逵; 王学浩

来源：中华肝脏病杂志, 2006, (11): 824-827.

• 癌
• 肝细胞
• 寡核苷酸类
• 靶基因 Carcinoma
• hepatocellolar
• Oligomicroarray
• Targeted gene

目的应用寡核苷酸芯片技术进行高通量分析原发性肝细胞癌与癌旁组织以及正常肝组织的差异表达基因,探索与肿瘤进展相关的靶基因。方法对原发性肝细胞癌患者的癌组织、癌旁组织以及正常肝组织,应用Trizol-步法进行总RNA抽提,10g/L琼脂糖凝胶电泳和芯片实验室进行RNA质量检测。总RNA纯化后进行逆转录cRNA合成、荧光标记和纯化,将癌组织和正常肝组织、癌组织和癌旁肝组织的cRNA探针分别与Agilent寡核苷酸芯片(21 074探针)进行杂交,洗涤后应用Agilent扫描仪获取图像,特征提取软件进行定量分析处理。挑选明显差异表达的基因进行SYBR Green I染料掺入的荧光实时逆转录聚合酶链反应...

• 单位
  南京医科大学第一附属医院; 生物芯片上海国家工程研究中心