广东HCV进化与注射吸毒者HCV NS5B区正向选择位点的分析研究

作者：王敏; 许茹; 廖峭; 钟惠珊; 黄杰庭; 杜荣松; 单振刚; 戎霞; 付涌水^*

来源：中国输血杂志, 2022, 35(06): 597-601.

DOI：10.13303/j.cjbt.issn.1004-549x.2022.06.001

• 丙型肝炎病毒
• HCV进化
• HCV选择压力
• 注射吸毒者
• 正向选择位点
• 直接抗病毒药物
• 广东

目的 了解广东HCV进化与注射吸毒者(IDUs)HCV NS5B区正向位点的选择压力情况。方法 随机收集广东141(人)份HCV RNA阳性献血者和58(人)份HCV患者标本做HCV NS5B序列扩增，结合前期测序得到的2009年～2011年的献血者和IDUs HCV NS5B序列，用分子进化遗传学分析(MEGA)软件做同源性分析，贝叶斯进化分析抽样树(BEAST)软件包做进化分析，用Datamonkey在线软件包进化的混合效应模型(MEME)方法对IDUs分离的序列做选择压力分析，用进化分析软件Arlequin的Tajima和Fu中性检验分析种群扩张情况。结果 本组IDUs不同亚型内部同源性比较结果为：HCV-3b同源性最高(97%),其次为HCV-3a(96%),HCV-6a(95%)和HCV-1b(94%);HCV进化速率分析显示：HCV-1b的进化速率最快[2.17E-03替换数/位点/年(y/y/y)],其次为HCV-3b(2.12E-03 y/y/y),HCV-3a(1.58E-03 y/y/y)和HCV-6a(1.28E-03 y/y/y); HCV理论感染人数分析：1980年～1990年是HCV-6a快速增长期，1990年～1995年是HCV-1b快速增长期，2000年～2007年是HCV-3a快速增长期；HCV群体遗传特征：HCV-1b、3a、 3b和6a均经历了种群扩张，其中3a和3b最明显。HCV选择压力分析：IDUs NS5B序列中339个核苷酸有2个正向选择位点(第235和243位点),但此段基因的5个直接抗病毒药物(DAA)位点仅在第316位点发生了突变[突变率1.24%(14/1 130)]。结论 广东地区HCV 3b进化呈明显的种群扩张趋势，尤其在当地IDUs中的比例、同源性较高，应作为本地区HCV防治的重点。鉴于广东IDUs HCV NS5B基因片段的正向选择位点均非DAA结合位点，因此设想DAA对这些患者有较好的疗效。

• 单位
  广州血液中心