胃癌患者伊立替康耐药前后基因表达谱的差异

作者：赵素芳; 李冬兵; 孙大勇^*

来源：广东医学, 2019, 40(17): 2465-2473.

DOI：10.13820/j.cnki.gdyx.20191329

• 胃癌
• 转录组测序
• 耐药
• 差异表达基因

目的旨在通过转录组测序,明确胃癌患者产生伊立替康耐药前后的基因表达谱差异。方法取胃癌患者用药前后的穿刺组织,进行RNA-seq,测序的覆盖度100×;对测序得到的原始数据通过生物信息学软件进行一些分析。结果生物信息学分析发现,胃癌患者耐药前后的组织转录水平分别有22 003和21 127个表达基因,其中有541个差异基因达到显著性水平;GO和KEGG分析发现这些差异基因主要富集在26条生物通路;这些通路与PI3K-Akt信号通路、胃酸分泌、黏附连接、蛋白质的消化和吸收、细胞周期和胆汁分泌相关;最终筛选得到的与胃癌产生伊立替康耐药密切相关的基因包括ABCA3、ADAMTS15、ALMS1、BCL2L11、C1QTNF6、CAPN9、COL12A1、COL5A3、COL7A1、IRF4、KRAS、MPP6、PCDHA1、PIK3CA、POU2AF1和USP13等。结论本研究提供了胃癌患者耐药前后的转录本信息,获得了与胃癌患者产生伊立替康耐药密切相关的潜在候选基因,为胃癌的个性化精准治疗提供一定的理论基础。

• 单位
  广州迈景基因医学科技有限公司; 深圳市第二人民医院