摘要

刺毛杜鹃是一种常绿的适应性良好的乡土杜鹃花。本研究基于RNA-Seq技术对刺毛杜鹃花朵样品进行了生物信息学方面的分析。测序数据经由序列组装,获得94 527条Unigene,分别与7大公共数据库比对,注释35 111条Unigene。其中31 056条Unigene在NR数据库中获得注释,注释的同源序列主要来自葡萄;21 451条Unigene在KOG数据库比对获得注释,被注释到25个类别中;18 678条Unigene在GO数据库中比对获得注释,在3大类中分50个亚类;32 469条Unigene在eggNOG数据库比对获得注释。所有Unigene中共检索到11 993个6种类型的SSR位点,单核苷酸重复数量最多。研究结果为深入挖掘刺毛杜鹃功能基因、开发SSR分子标记提供了基础数据。

  • 单位
    浙江省林业科学研究院