细粒棘球绦虫葡萄糖转运蛋白GLUT3的生物信息学分析及系统发育树

作者：库尔班尼沙·阿马洪; 刘辉; 李锦田; 田春艳; 王建华^*; 吕国栋^*

来源：中国病原生物学杂志, 2020, 15(08): 910-916.

DOI：10.13350/j.cjpb.200809

• 细粒棘球绦虫
• 葡萄糖转运蛋白3(GLUT3)
• 生物信息学分析
• 系统进化树

目的基因克隆及获取细粒棘球绦虫葡萄糖转运蛋白3(Echinococcus granulosus Glucose transporter 3,EgGLUT3)基因全长序列,并进行生物信息学分析。方法拟通过全长基因PCR方法克隆获取EgGLUT3基因序列。利用生物信息学工具对其基因进行生物信息分析。结果从细粒棘球蚴原头蚴(E.granulosus protoscoleces,EgPSCs)成功克隆获得1 530bp的EgGLUT3基因,属于SLC2A (Solute carrier family 2)家族的GLUTs家族,相对分子量为55192.22,18-19之间有一个裂解位点。有3个酰胺化位点,7个糖基化位点,1个cAMP和cGMP依赖的蛋白激酶磷酸化位点,4个酩蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,11个酰基化位点,3个蛋白激酶c磷酸化位点。具有12个跨膜区域,亲水性平均值范围是-2.567～3.44。二级结构中α螺旋约占53.83%,β折叠约占16.90%,β转角约占5.30%,无规卷曲约占23.97%。从8～286氨基酸位置发现MFS家族(Major Facilitator Super family)结构域(E-value 2.5e-17)。EgGLUT3氨基酸序列与其他物种的相似性11.31%到84.82%。其基因跟人类、狗、小鼠、白马鱼和果蝇等哺乳动物的亲缘关系较远。结论这项研究为研究EgGLUT3参与E.granulosus从中间宿主体内摄取葡萄糖的机制和鉴定抗包虫药物靶点的重要组成部分,为研发新型抗包虫药物奠定基础。

• 单位
  新疆医科大学第一附属医院; 新疆医科大学