基于网络药理学和分子对接法的化湿败毒方对抗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）分子机制初步研究

作者：刘畅; 孙磊; 聂晶; 丁艳娇; 吴记勇^*

来源：辽宁中医药大学学报, 2021, 23(11): 56-63.

DOI：10.13194/j.issn.1673-842x.2021.11.012

• 网络药理学
• 化湿败毒方
• 新型冠状病毒肺炎
• 靶点
• 信号通路

目的《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案》第七版中针对新冠肺炎重型疫毒闭肺证推荐使用化湿败毒方。该研究通过网络药理学的方法,筛选化湿败毒方的所含化学成分,构建成分-疾病靶点网络,对其进行抗新型冠状病毒肺炎分子机制的初步研究。方法通过TCMSP和Drugbank数据库,筛选化湿败毒方所含化学成分,并获取其作用靶点;在Genecard数据库检索COVID-19相关的疾病靶点;通过R程序获得药物和疾病的共同靶点并导入Sring数据库得到蛋白互作关系,同时通过Cytoscape 3.7.2构建蛋白互作关系和成分-疾病靶点的网络信息。基于生物信息学开源软件Bioconductor和R程序对化湿败毒方作用的GO和KEGG进行富集分析。以该研究中药物网络中结合位点数目高的化合物黄芩素为代表,通过autoDock软件与SARS-COV-2 3CL水解酶和ACE2进行分子对接。结果化湿败毒方的106个成分调控328个对应的作用靶点和23个疾病潜在靶点。GO功能富集分析得到GO条目1288个,其中生物过程(BP)1233个,细胞组成(CC)16个,分子功能(MF)39个。KEGG通路富集筛选得到137条信号通路。结论该研究基于网络药理学方法预测化湿败毒方治疗COVID-19的可能的成分为汉黄芩素、黄芩素、葛花苷元、甘草查尔酮A、芒柄花黄素。通过调节MAPK、PTGS、IL6、FOS、CALM1、CASP3、RELA、RB1、BAX等靶点,调控甲型流感、百日咳、肺结核、TNF、IL17、AGE-RAGE、C-type lectin recepto等信号通路,发挥其抑制炎症、调节细胞周期,减轻病毒引起的肺损伤作用。该研究阐明化湿败毒方所含成分与新型冠状病毒肺炎的关系,为临床药物治疗提供了科学依据。