摘要
目的:探究氧化应激相关基因在牙周炎中的生物途径和分子机制,寻找牙周炎潜在的生物标记物和治疗药物。方法:利用R软件筛选牙周炎的差异表达氧化应激相关基因并进行富集分析和蛋白互作分析,以寻找关键通路和基因。对关键基因进行受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic, ROC)分析以探究其对牙周炎的诊断价值。利用相关数据库预测靶向关键基因的miRNA、转录因子和治疗药物。最后在外部数据集和体外模型中验证氧化应激相关关键基因的表达。结果:筛选出54个差异表达氧化应激相关基因。蛋白互作分析鉴定出9个关键基因,其中6个ROC分析曲线下面积(AUC)>0.7且被外部数据集和体外模型验证。共预测出96个miRNA,131个转录因子和17种药物靶向这些关键基因。结论:氧化应激相关基因EGFR、FOS、IL6、MMP2、MMP9、NFE2L2可能是牙周炎潜在的生物标记物。
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单位武汉大学中南医院