北京鸭呼肠孤病毒σA、σB蛋白的二级结构及B细胞抗原表位的预测

作者：刘红; 樊惠英; 朱朝辉; 罗琼; 吴志新; 廖明

来源：华南农业大学学报, 2009, (03): 90-94.

• 北京鸭呼肠孤病毒
• σA蛋白
• σB蛋白
• B细胞表位 reovirus strain from Peking ducks
• protein σA
• protein σB
• B cell epitopes

应用SOPMA方法和DNAStar Protean软件综合分析了北京鸭呼肠孤病毒分离株DRV-GZ株的σA、σB蛋白的二级结构、亲水性、表面特性、柔韧性和抗原指数,并对各个蛋白的B细胞抗原表位进行了预测.结果表明,σA蛋白的32~37,56~61,82~85,107~116,128~141,202~207,239~246,256~260,274~280,312~317,381~391和σB蛋白的62~86,117~123,141~163,179~186,270~275,287~289,343~345区域内或附近最有可能是B细胞抗原表位的优势区域.

• 单位
  华南农业大学; 广东省农业科学院畜牧研究所