静脉注射吸毒感染者体内HIV-1CRF07_BC的准种变异特征

作者：辛若雷; 马泽芹; 程春林; 邢辉; 洪坤学; 阮玉华; 李佳; 卢红艳; 邵一鸣; 何翔

来源：病毒学报, 2013, (03): 316-322.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.002393

• 人类免疫缺陷病毒
• 单基因组扩增
• 病毒准种
• 重组
• 遗传多样性 HIV
• Single genome amplification
• Viral quasispeices
• Recombination
• Genetic diversity

为了研究静脉注射吸毒者(IDU)体内HIV-1CRF07_BC病毒准种变异和遗传多样性特征,本文采用单基因组扩增(SGA)技术分别从6份CRF07_BC感染者血浆获得HIV-1病毒准种env基因gp120片段序列11～28条,采用构建系统进化树的方法进行聚类分析,描述感染者血浆中CRF07_BC病毒准种的变异特征;运用Simplot软件、分段系统进化树和对平均两两比对基因距离进行遗传多样性作图(Diversity plot)的方法分析病毒准种间的重组。系统进化树分析结果显示仅1个病例具有较高的遗传同质性,而其他5个病例的遗传异质性较高,主要表现为系统进化树上形成2～4个次级进化簇。此外,有3个...

• 单位
  中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心; 传染病预防控制国家重点实验室; 南开大学; 北京市预防医学研究中心; 生命科学学院