一个A亚族铁皮石斛蛋白磷酸酶2C基因的分子特征研究

作者：李依民; 李元敏; 梁小燕; 张明英; 高静; 颜永刚; 郭顺星^*; 张岗^*

来源：中国药学杂志, 2020, 55(14): 1195-1200.

• 铁皮石斛
• 蛋白磷酸酶
• 生物信息学
• 定量PCR
• 信号

目的克隆珍稀濒危兰科药用植物铁皮石斛蛋白磷酸酶(protein phosphatase,PP)基因DoPP2C2并进行生物信息学和表达模式分析。方法采用RACE和RT-PCR获基因全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用DNASTAR 7.0和MEGA 6.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助定量PCR检测基因表达模式。结果分离到DoPP2C2基因(Gen Bank注册号KT957553),cDNA全长1 624 bp,编码一条由387个氨基酸组成的多肽,相对分子质量42.76×103,等电点7.03; DoPP2C2蛋白具有植物PP2Cs蛋白家族保守的2个蛋白磷酸酶结构域(91～152、216～376);该蛋白无信号肽或跨膜域,定位在细胞核,系亲水性蛋白; DoPP2C2蛋白与多种植物PP2C蛋白一致性较高(47.8%～73.4%); DoPP2C2隶属于拟南芥和水稻PP2C蛋白家族进化树的A亚族,与OsPP2C30亲缘关系较近; DoPP2C2基因表达有器官差异,根和茎中相对表达量为叶的0.76和0.59倍。结论获得一个A亚族铁皮石斛蛋白磷酸酶DoPP2C2基因全长及分子特征,为深入研究该基因在铁皮石斛生长发育中的分子作用奠定基础。

• 单位
  陕西中医药大学; 中国医学科学院药用植物研究所