通过生物信息学方法筛选新的肝细胞癌复发关键蛋白

作者：杨永勤; 冯巩; 郝帅; 陈敏; 梁甜; 闫红林; 贺娜^*

来源：肝脏, 2022, 27(11): 1170-1174.

DOI：10.14000/j.cnki.issn.1008-1704.2022.11.011

• 肝癌
• 蛋白质组学
• 临床蛋白质组学肿瘤分析联盟

目的 寻找肝癌复发新的标志物。方法 本研究的蛋白质组学数据来自临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium, CPTAC)数据库。将下载的数据根据肝癌是否复发进行分组，分析两组之间的差异蛋白。生存分析、Cox回归和ROC曲线被用来筛选更具临床意义的差异蛋白。在人类蛋白图谱数据库中对关键的蛋白进行了验证。结果 在50例复发和77例未复发的乙型肝炎相关肝癌患者中，获得了690个差异表达蛋白。其中，39个蛋白与肝癌的生存分析相关，18个蛋白是肝癌预后的独立影响因素，7种蛋白(BAHCC1、ESF1、RAP1GAP、RUFY1、SCAMP3、STK3和TMEM230)对肝癌5年生存预测的ROC曲线下面积>0.7。结论 本研究发现了预测肝癌复发的新蛋白，这些关键蛋白是肝癌预后的独立影响因子。

• 单位
  西安医学院第一附属医院; 西安医学院