基于生物信息学分析的乳腺癌4-miRNAs预后模型

作者：邓姗姗; 张廷友^*; 李宁^*

来源：海南医学, 2021, 32(07): 817-820.

• miRNA
• 乳腺癌
• 预后模型
• TCGA
• 生物信息学

目的构建乳腺癌患者微小RNA (miRNA)预后模型,为其个体化管理提供理论依据。方法从TCGA (the Cancer Genome Atlas)数据库下载乳腺癌的miRNA、mRNA表达谱及临床数据,通过单因素和多因素COX回归分析构建miRNA预后模型,采用受试者工作特征曲线(ROC)及曲线下面积(AUC)检验模型的敏感性和特异性;通过靶基因预测软件预测4-miRNAs模型的靶基因,将得到的靶基因与乳腺癌中差异表达的mRNA取交集后进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;通过STRING网站构建PPI网络(protein protein interaction network);通过Cytoscape3.8.2软件筛选出4-miRNAs模型的核心基因。结果 4-miRNAs预后模型中实验组、验证组及所有样品组预测乳腺癌患者5年生存率ROC曲线下AUC值分别为0.868、0.669、0.802;单因素Cox回归分析提示4-miRNAs预后模型与总生存率相关(HR=1.325,P=0.005),多因素Cox回归分析提示4-miRNAs预后模型可作为影响乳腺癌患者生存率的独立预后因素(HR=1.325,P=0.006)。结论 4-miRNA模型能够有效预测乳腺癌患者预后,建议针对高风险型患者采取积极的治疗手段。

• 单位
  遵义医科大学