铁皮石斛RRT家族全基因组鉴定及表达分析

作者：聂聪; 龙小琴; 何基泽; 孙语钒; 赵欣宇; 王万军^*; 朱乾坤^*

来源：西北农业学报, 2022, 31(12): 1605-1614.

• 铁皮石斛
• 鼠李半乳糖醛酸聚糖Ⅰ鼠李糖转移酶RRT
• 生物信息学分析
• 表达分析

多糖是药用植物铁皮石斛(Dendrobium officinale)的主要成分之一。鼠李半乳糖醛酸聚糖Ⅰ鼠李糖转移酶(rhamnogalacturonⅠrhamnosyltransferase, RRT)在Ⅰ型鼠李半乳糖醛酸聚糖的合成中起重要作用。利用生物信息学在全基因组水平鉴定出4个铁皮石斛RRT家族基因( DoRRT1、 DoRRT2、 DoRRT3、 DoRRT4),通过逆转录定量PCR检测该基因家族在不同组织和胁迫下的表达情况。结果表明：在系统发育上DoRRT1、DoRRT3被聚为一组，DoRRT2、DoRRT4被聚为一组；DoRRT蛋白均为亲水蛋白质，可定位于高尔基体；DoRRT蛋白的α-螺旋和无规卷曲较多；4个DoRRT蛋白均有O-FucT保守结构域；组织表达显示 DoRRT1、 DoRRT2、 DoRRT4在根、茎、叶中均有表达，且在地上部的转录水平较高；胁迫表达表明 DoRRT2、 DoRRT4在高温胁迫下表达显著下调， DoRRT2在PEG模拟干旱条件下表达显著下调，说明 DoRRT2、 DoRRT4参与非生物胁迫响应。以上结果为深入研究DoRRT的生物学功能提供数据支撑。

• 单位
  西南交通大学