基于matK和ITS2及二级结构对药材香薷及其混伪品的鉴别研究

作者:郑梦迪; 张春; 马瑞龙; 张彦; 汪兴军; 秦蓓*
来源:中国现代应用药学, 2022, 39(17): 2222-2228.
DOI:10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2022.17.008

摘要

目的 快速、准确鉴别药材香薷及其混伪品,保障香薷的药材质量和用药安全。方法 收集石香薷、江香薷和香薷植物材料分别进行matK和ITS2序列的扩增与测序,测序结果经Codon Code Aligner软件校对,同时从GenBank下载石香薷、江香斋及其易混品种海州香薷、香薷、密花香薷、牛至等物种的matK和ITS序列。其中,ITS序列经隐马尔可夫模型去除两端的5.8S和28S序列,共得到16个物种的ITS2序列50条;经Clustal软件校对共获得9个物种的matK序列28条。通过Mega7.0软件分析matK和ITS2序列,计算所有物种种内和种间遗传距离,构建邻接法(neighbor joining,NJ)聚类树,通过ITS2 Database预测ITS2二级结构,采用4Sale软件比对二级结构,通过ProfDistS软件构建基于联合ITS2一级序列及其二级结构的剖面邻接(profile neighbor-joining,PNJ)系统发育树。结果 基于matK和ITS2序列的遗传距离均表明香薷正品与其各种混伪品之间存在明显barcoding gap。NJ和PNJ进化树的拓扑关系一致,可以区分药材香薷及其混伪品。香薷的ITS2二级结构与其各混伪品具有显著差异。结论 建议matK和ITS2序列均可以作为鉴别香薷与其混伪品的DNA条形码,ITS2二级结构信息的加入可丰富鉴定结果,为香薷药材的准确鉴别、香薷属与石荠苎属植物的科学分类提供参考。

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