欧洲黑杨PnEXPA1基因多态性与稳定碳同位素比率的关联分析

作者：张伟溪; 褚延广; 黄秦军; 张冰玉; 丁昌俊; 苏晓华

来源：林业科学研究, 2014, 27(03): 349-355.

DOI：10.13275/j.cnki.lykxyj.2014.03.009

• 欧洲黑杨
• 伸展蛋白基因
• 单核苷酸多态性
• 稳定碳同位素比率
• 关联分析

对欧洲黑杨α-expansin基因PnEXPA1的SNP多态性与水分利用效率相关性状稳定碳同位素比率(δ13C)进行了关联分析。利用SNaPshot技术对PnEXPA1基因内11个SNP位点进行了基因型分型,发现各SNP位点优势基因型均为纯合,且其频率高于杂合基因型。关联分析显示:SNP8和SNP12在采用单因素方差分析(ANOVA)和一般线性模型(GLM)2种方法时均与δ13C值显著关联。SNP8为exon 1内的无义突变,可解释6.620%的表型变异;而SNP12位于intron 1中,遗传贡献率为6.613%;这2个SNP位点与SNP9、SNP13共同位于一个高连锁不平衡(LD)的单倍型块中。SNP8与SNP12的TT基因型无性系均具有较高的δ13C值,为优势基因型。

• 单位
  中国林业科学研究院林业研究所; 林木遗传育种国家重点实验室