21单体综合征流产胎儿绒毛膜组织DNA 6mA的修饰研究

作者：胡慧帆; 戴勇; 梁灼健; 何慧燕; 周俊; 胡芷洋; 徐勇; 郭辉; 汤冬娥^*

来源：中华医学遗传学杂志, 2020, 37(07): 747-750.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2020.07.011

• 21单体综合征
• N6-甲基腺嘌呤
• 测序
• GO富集分析
• KEGG富集分析

目的探究DNA的N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenine, 6mA)修饰在21单体综合征流产胎儿绒毛膜组织基因组中的分布特点及与21单体综合征临床症状的关系。方法从4例实验组流产胎儿绒毛膜组织(核型为45, XY, -21)样本和4例对照组流产胎儿绒毛膜组织(核型为46, XY)样本中提取DNA, 经质量和纯度检测合格后, 采用6mA抗体进行染色质免疫共沉淀反应(chromatin immunoprecipitation, ChIP), 之后进行测序。对得到的测序数据进行生物信息学分析, 研究6mA位点修饰在实验组和对照组中的差异。结果峰(peaks)的相关差异基因的分析表明, 在全基因组范围内, 对照组相比实验组拥有更多的含6mA修饰的基因, 其中对照组特有的含6mA修饰的基因为4607个, 实验组仅有1059个。在21号染色体范围内, 两组之间的这一差异更加明显。在实验组中特有的含6mA的基因为1769个, 而对照组则高达8032个。不同范围内的分析结果都表明在21单体综合征中基因6mA修饰的水平偏低。GO富集分析和KEGG富集分析结果均表明21单体综合征中缺失的6mA基因与胚胎生长发育有着密切关系。结论人体中的DNA 6mA修饰可能在胚胎生长发育方面发挥着与5mC(5-methylcytosine, 5mC)修饰相似的作用。

• 单位
  深圳市人民医院; 暨南大学; 第二临床医学院