葡萄VvGCN5的鉴定及互作蛋白筛选

作者：陈雪琴; 庞倩倩; 裴丹; 任艳华; 房经贵^*

来源：南京农业大学学报, 2023, 1-11.

• 葡萄
• VvGCN5
• 酵母双杂
• 双分子荧光互补
• 生物信息学分析

[目的]本文旨在揭示General control non-repressible 5 (GCN5)在葡萄生长发育过程中的调控机制，并筛选出与VvGCN5互作的蛋白，以期为进一步构建VvGCN5在葡萄生长发育中的调控网络提供理论基础。[方法]利用生物信息学技术对VvGCN5的蛋白二级结构、基因结构、功能域、启动子的顺式作用元件以及抗逆的表达量和时空表达进行分析。并在烟草中进行亚细胞定位，研究VvGCN5表达位置。通过酵母双杂技术筛选与VvGCN5互作的蛋白，并通过BIFC进行验证。[结果] VvGCN5的二级结构由α-螺旋、延伸链、β-折叠以及无规则卷曲构成，含有10段内含子序列和11段CDS序列，拥有Acetyltransf＿1和Bromodomain结构域，以及ARE、GT1-motif、TGACG-motif、CAT-box、CGTCA-motif等顺式作用元件。通过查询GEO数据库发现VvGCN5可能受到光照和霜霉病的影响。VvGCN5主要表达于葡萄的成熟茎、萌芽初期、心皮、种子中。亚细胞定位发现VvGCN5位于细胞核和细胞膜上。此外，以pGBKT7-VvGCN5作为诱饵蛋白，通过酵母双杂交技术和双分子荧光互补技术发现了8个阳性蛋白与VvGCN5互作。[结论]本研究鉴定并分析了VvGCN5的基本信息，并得到了8个与VvGCN5互作的蛋白。

• 单位
  南京农业大学