基于16S rRNA测序技术分析山羊皮肤脓包菌群结构特征

作者：杨金柯; 郝雨; 崔卉梅; 赵登率; 袁兴国; 陈学辉; 杨博; 张婷; 郑海学; 刘湘涛; 张克山^*

来源：中国兽医科学, 2021, 51(09): 1073-1081.

DOI：10.16656/j.issn.1673-4696.2021.0160

• 山羊
• 皮肤脓包
• 16S rRNA
• 微生物多样性
• 菌群结构

为探讨山羊体表脓包中的微生物多样性,运用高通量测序技术对脓包积液中的16S rRNA和ITS基因测序。根据获得的有效序列和操作分类单元(OTU)数目,进行α多样性分析和菌群结构组成分析。结果表明,脓包中细菌和真菌OTU数目分别为53和410;细菌群落中优势菌属分别为葡萄球菌属(Staphylococcus,98.04%)、梭杆菌属(Fusobacterium,80.62%)和拟杆菌属(Bacteroides,19.32%),真菌群落中没有明显优势菌群。本研究通过16S rRNA高通量测序技术,分析了可能引起山羊皮肤脓包的病原微生物,为皮肤脓包病的防控和临床指导用药提供了参考。

• 单位
  农业部; 家畜疫病病原生物学国家重点实验室; 中国农业科学院兰州兽医研究所