摘要
目的 了解2020-2021年河南省漯河市严重急性呼吸道感染(SARI)病例中的人呼吸道合胞病毒(HRSV)基因特征。方法 采集2020年4月至2021年3月漯河市中心医院因SARI住院的病例标本,用荧光定量PCR法进行HRSV病毒核酸检测,对检测阳性标本使用RT-PCR法进行HRSV G基因第二高变区扩增,使用CExpress以及MEGA7.0软件进行序列编辑、进化树构建和基因特征分析。结果 共采集SARI咽拭子标本170份,其中HRSV核酸检测阳性标本15份(8.8%)。对阳性标本进行靶基因扩增后获得12条序列,经分析全部为HRSVB亚型的BA9基因型。8条序列与来自欧洲的BA9基因型序列汇成一簇,处于进化树顶端;4条序列与来自国内和澳洲的BA9基因型序列汇成一簇。与参考株相比,12条序列在重复插入的60个碱基区及aa164-176区域出现突变,同时存在253NITT糖基化位点的增加和276 NSTQ糖基化位点的缺失。结论 HRSV B亚型是2020-2021年河南省漯河市SARI病例中流行的亚型,BA9基因型为流行基因型,与流行株相比变异较大,应对BA9基因型HRSV进行持续深入的监测,为科学防控SARI提供依据。
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单位河南省疾病预防控制中心; 漯河市疾病预防控制中心