白桦TLP基因家族生物信息学及组织表达特异性分析

作者：毕德泷; 宁小萌; 孙晶晶; 冯思雨; 李然红^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(03): 802-808.

DOI：10.13271/j.mpb.020.000802

• 白桦(Betula platyphylla)
• 类甜蛋白
• 生物信息学
• 组织表达

为全面了解白桦类甜蛋白(thaumatin-like protein, TLP)基因家族成员的结构、功能和表达特性，本研究采用同源序列比对法，从白桦基因组数据库中筛选并鉴定到41个类甜蛋白基因家族成员，分别命名为BpTLP1～BpTLP41，对其进行生物信息学分析，并通过半定量对白桦TLP家族成员的组织表达特异性进行了分析。结果表明，41个白桦类甜蛋白家族成员分别定位在11条染色体上，其中8号染色体分布最多，包括14个家族成员。该家族成员的氨基酸数量在336～975 aa之间，分子量在28 054.11～81 966.03 kD之间，理论等电点在5.01～5.21之间，偏酸性。基因半定量结果表明，41个白桦TLP家族成员在根、茎、叶中均有不同程度的表达，其中，BpTLP35、BpTLP39在叶片中表达量较高，Bp TLP14、BpTLP35、BpTLP36在茎中表达量较高，BpTLP41、BpTLP3在根中表达量较高。

• 单位
  牡丹江师范学院