草酸钙结石晶体粘附对人肾上皮细胞lncRNA表达谱的影响

作者：王铸; 张建文; 张颖; 张圣平; 孙睿; 植凡; 胡七一; 邓琼; 梁辉

来源：现代泌尿外科杂志, 2018, 23(01): 52-56+76.

• 草酸钙结晶
• 肾结石
• lncRNA
• RNA seq

目的比较分析肾结石草酸钙晶体对人肾上皮细胞lncRNA的表达谱的影响,筛选差异表达的lncRNA并初步探讨其与肾结石的关系。方法选取临床经结石成分分析为草酸钙的肾结石标本,充分研磨后配制草酸钙晶体悬液处理人肾上皮细胞HK-2细胞,通过MTT法测定草酸钙晶体对HK-2细胞生长的影响;提取总RNA并通过高通量转录组测序平台HiSeq 2500进行lncRNA表达谱差异性分析。对筛选获得的差异lncRNA进行Real-Time PCR验证,并通过Gene Ontology数据库和KEGG信号通路初步分析其功能。结果草酸钙晶体在数分钟内便粘附于HK-2细胞表面,并且显示出明显的细胞毒性,细胞生长速度减慢且引起细胞形态以及培养基pH值发生显著改变。RNA seq结果显示经草酸钙晶体处理后的HK-2细胞中差异表达的lncRNA有25个,其中上调表达的9个,下调表达的16个。通过实时定量RT-PCR进行验证,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论草酸钙结晶对人肾上皮细胞lncRNA以及mRNA表达有显著影响,并且这些lncRNA的异常表达可能与肾结石发病有关。

• 单位
  深圳市龙华区人民医院