梅花鹿接种卡介苗对信号通路影响的RNA-seq分析

作者：姜棋文; 杨雪瑶; 葛楠; 孙江洋; 葛桂阳; 尹纪营; 苏凤艳^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2021, (17): 118-151.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.01.0225

• 卡介苗
• 梅花鹿
• 转录组测序
• GO功能注释
• KEGG富集

为了研究梅花鹿接种卡介苗前后信号通路的变化情况,取接种卡介苗(DF组)和未接种卡介苗(SY组)的梅花鹿外周血进行转录组测序,构建mRNA文库,利用DESeq软件对获得的mRNA进行差异表达分析,根据分析结果,选取免疫相关表达上调基因进行qPCR验证。结果表明:DF组和SY组共有1 337个显著差异表达的基因,其中上调基因658个,下调基因679个;差异基因主要参与机体应激、信号转导、调节白细胞迁移等生物学过程。梅花鹿接种卡介苗后主要富集到PI3K-Akt、Notch、NF-κB、Toll样受体以及细胞外基质受体相互作用等免疫相关的信号通路。qPCR检测结果与高通量测序结果一致。说明接种卡介苗后,梅花鹿体内的蛋白质及细胞外基质修饰过程得到了增强,受体活性肽、转录因子的结合能力和细胞因子活性增强。

• 单位
  吉林农业大学