我国柯萨奇病毒A组6型VP1区基因分子流行病学特征

作者：范云燕; 欧嵩凤; 陈敏玫^*

来源：中华疾病控制杂志, 2020, 24(08): 934-945.

DOI：10.16462/j.cnki.zhjbkz.2020.08.014

• 柯萨奇病毒A组6型
• VP1区基因
• 分子流行病学

目的分析我国2010―2018年柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)毒株VP1区基因流行和进化规律,为手足口病的防治提供科学依据。方法从GenBank获得2010―2018年我国CV-A6病毒全长VP1区核苷酸序列,用MEGA V7.0和Interactive Tree of Life V5 (iTOLV5)软件构建进化树,用DNAstar V8.1.3软件对核苷酸同源性进行分析。结果 880条序列来源的CV-A6毒株以D3亚型为主,占毒株总数的95.45%,不同基因型核苷酸同源性为80.8%～86.0%,同基因型内核苷酸同源性为88.1%～100.0%。D2亚型VP1区相对稳定,无整体氨基酸变异情况;而D3毒株VP1区发生多点氨基酸替换,其中A5T、T283A、N137S、V242I、A30V、I174V氨基酸替换循环出现,这种进化模式与越南地区相似,但与日本地区却不同。VP1区5T、30A、137N、242V比例逐年增加,可能与CV-A6引起我国手足口的轻症和重症病例比例上升有关。结论具有VP1区遗传多样性的CV-A6 D3株的出现可能是CV-A6在反复流行的一个重要因素,这有助于解释我国CV-A6的流行情况和流行特点。

• 单位
  南宁市疾病预防控制中心; 广西壮族自治区疾病预防控制中心