玉米穗型和粒型性状的GWAS及其关联位点驯化和改良分析

作者：钱佳翼; 柳俊; 方圆; 杜勇成; 杨天天; 李鹏程; 杨泽峰; 徐辰武^*

来源：玉米科学, 2020, 28(06): 45-51.

DOI：10.13597/j.cnki.maize.science.20200607

• 玉米
• 穗型
• 粒型
• 关联分析
• 驯化
• 改良

以32份大刍草、68份玉米地方品种和来源广泛的294份玉米自交系为材料,在对294份玉米自交系进行简化基因组测序的基础上,采用GWAS方法对11个玉米穗型和粒型性状进行关联分析。结果表明,11个性状共检测到44个关联的SNP位点,其中,28个位点与6个穗型性状相关联,16个位点与3个粒型性状相关联。进一步整合32份大刍草和68份地方品种相应位点的序列数据,44个关联位点中共发现29个SNP在3类群体间共有。通过Fisher的精确检验发现,7个SNP的等位基因频率在大刍草到地方品种中发生了显著变化,14个SNP的等位基因频率在地方品种到自交系中发生了显著变化,3个SNP的等位基因频率则在大刍草到地方品种以及地方品种到自交系中均发生了显著变化,表明这些位点可能经历了驯化或/和人工改良。

• 单位
  江苏省作物遗传生理重点实验室; 扬州大学