基于Oncomine和GEPIA数据库分析NFE2L3基因在结直肠癌中的表达及其临床意义

作者：吕赤; 梁逸超; 闫兆鹏; 吴迪; 王大路; 王鹤令; 苏琪; 殷红专^*

来源：中华临床医师杂志(电子版), 2018, 12(12): 651-658.

DOI：10.3877/cma.j.issn.1674-0785.2018.12.001

• 人核因子红细胞2相关因子3
• 结直肠癌
• Oncomine
• 基因表达谱,交互分析

目的通过挖掘Oncomine和GEPIA数据库中的相关数据,分析NFE2L3基因在结直肠癌中的表达及临床意义。方法检索Oncomine和GEPIA数据库中有关结直肠癌的数据并结合文献资料进行二次综合分析。癌与正常组织之间基因表达差异采用t检验,采用单因素方差分析比较不同临床分期之间基因表达的差异,采用Pearson相关分析进行相关性研究,采用Kaplan-Meier方法进行生存分析。结果 Oncomine数据库中共收集了334项关于NFE2L3基因在不同类型癌与正常组织中表达的比较的研究结果,表达差异有统计学意义的研究结果有55个。其中共有21项研究涉及NFE2L3基因在结直肠癌组织和正常结直肠组织中的表达,共包括1000个样本。与对照组相比结直肠癌组织中NFE2L3 mRNA表达显著高于结直肠正常组织(P <0.05)。GEPIA数据库中分析发现NFE2L3基因的表达与错配修复基因MLH1、MSH2、MSH6和PMS2的表达均呈显著相关性(P <0.05);NFE2L3基因与结直肠癌的临床分期与预后生存(总生存率和无病生存率)均不具有相关性(P> 0.05)。结论 NFE2L3 mRNA在结直肠癌组织中呈高表达,并与影响结肠癌发生的错配修复基因的表达关系密切。

• 单位
  中国医科大学附属盛京医院