百日咳鲍特菌脉冲场凝胶电泳分子分型方法的优化和应用

作者：刘淳婷; 田慧; 赵苏晔; 高源; 严佳; 刘铭; 叶绪芳; 韦小瑜^*; 李世军^*

来源：中国疫苗和免疫, 2022, 28(03): 282-287.

DOI：10.19914/j.CJVI.2022055

• 百日咳
• 百日咳鲍特菌
• 脉冲场凝胶电泳
• 分子分型

目的 优化百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis,B. P)脉冲场凝胶电泳(Pulsed field gel electrophoresis, PFGE)分型方法。方法 依据已发表文献和实验室现有条件,优化B. P的PFGE电泳条件和条带标准化方法,将优化后的方法用于分析贵州省B. P分离株。结果 当采用XbaI内切酶时B. P PFGE的最优脉冲时间、电泳时长分别为5-21s、20h,当采用SpeI内切酶时分别为5-45s、22h。同时使用两种内切酶时,λLadder电泳图谱比H9812菌株电泳图谱更适合作为B. P PFGE分析的标准化参考。2017-2018年贵州省16株B. P分离株采用XbaI可分为16种谱型(PX01-PX16),采用SpeI可分为12种谱型(PS01-PS12),XbaI的分辨力(DI=0.937 5)高于SpeI(DI=0.906 3)。结论 优化后的方法更适于B. P PFGE分析;贵州省B. P分离株的PFGE谱型存在多态性。

• 单位
  中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 贵州省疾病预防控制中心; 贵州医科大学; 传染病预防控制国家重点实验室