东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A蛋白的分子特性及系统进化分析

作者：叶亚萍; 吴鹰; 钱加珺; 赵浩东; 吉挺; 蔺哲广; 徐细建; 陈大福; 郭睿^*

来源：安徽农业大学学报, 2023, 50(04): 632-637.

DOI：10.13610/j.cnki.1672-352x.20230824.014

• 东方蜜蜂微孢子虫
• 锌指蛋白krab-a结构域
• KRAB-A基因
• 生物信息学分析

为明确KRAB-A的分子特性并进行东方蜜蜂微孢子虫与其他物种KRAB-A蛋白的系统进化分析，以期丰富KRAB-A的基本信息，使用NCBI数据库中的ORF工具预测KRAB-A蛋白的氨基酸序列。利用ExPASy网站上的相关软件预测和分析KRAB-A蛋白的亲水性、信号肽、磷酸化位点、二级结构及三级结构。通过Mega11.0软件采用邻接法构建基于KRAB-A蛋白的系统进化树。结果显示，KRAB-A基因可编码1 018个氨基酸；KRAB-A蛋白的分子式为C5314H8526N1522O1556S43，分子量约为120.00 kDa，等电点为9.33，脂溶系数为79.20，亲水性为-0.75;KRAB-A含有41个丝氨酸、21个酪氨酸和16个苏氨酸磷酸化位点，1个H2C2模体，但不含有信号肽；KRAB-A含44.40%的α-螺旋，5.40%的β-转角，16.50%的延伸及33.69%的无规卷曲；蜜蜂微孢子虫的1个KRAB-A蛋白(NAPIS＿ORF00138)与明球囊霉的2个KRAB-A蛋白(RCL2＿000589200和RCL2＿003114000)中存在与东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A蛋白中相同的H2C2模体；东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A(AAJ76＿2380003054)与其姐妹种蜜蜂微孢子虫KRAB-A(NAPIS＿ORF01514)聚为一支。研究结果明确了东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A基因的分子特性，揭示KRAB-A可能是一种亲水性蛋白和胞内蛋白，东方蜜蜂微孢子虫KRAB-A(AAJ76＿2380003054)与蜜蜂微孢子虫KRAB-A(NAPIS＿ORF01514)间具有很高的保守性，为进一步的功能研究提供依据。

• 单位
  福建农林大学; 扬州大学; 动物科学学院; 江西省养蜂研究所