大鼠骨髓基质细胞分化为施万细胞样细胞过程中的基因表达变化

作者：陈娇; 张丹丹; 李军平; 牛建国; 何仲义; 贾桦^*

来源：神经解剖学杂志, 2021, 37(03): 315-322.

DOI：10.16557/j.cnki.1000-7547.2021.03.011

• 骨髓基质细胞
• 施万细胞样细胞
• 分化
• 转录组测序
• 大鼠

目的:利用转录组测序技术(RNA-seq)检测骨髓基质细胞(BMSCs)分化为施万细胞(SCs)样细胞过程中基因表达谱的变化,筛选与分化相关的差异表达基因,并分析与分化相关的信号通路。方法:体外培养大鼠BMSCs,用三步诱导法对其进行诱导,在复合生长因子诱导第12 h和7 d收集样本。经Illumina测序平台对BMSCs、诱导培养基(DM)诱导12 h(DM-12 h)和7 d(DM-7 d)的细胞进行生物信息分析,采用Cluster Profiler软件对差异基因集进行GO功能和KEGG代谢通路富集分析。结果:与BMSCs组相比,DM-12 h组有578个基因表达上调,632个基因表达下调;与DM-12 h组相比,DM-7 d组有1165个基因表达上调,872个基因表达下调;与BMSCs组相比,DM-7 d组有629个基因表达上调,529个基因表达下调。经Venn分析,共筛选出140个在各阶段共同表达的差异基因,其中与分化相关的基因主要富集在细胞周期、DNA复制和p53信号通路;并确定Ccne2、Mcm3和Rrm2可作为下一步研究的候选基因。结论:本研究首次基于转录组测序构建BMSCs诱导分化为SCs样细胞的基因表达谱,揭示分化过程中的差异基因,并筛选出Ccne2、Mcm3和Rrm2作为研究目的基因,为阐明BMSCs分化为SCs样细胞的机制提供依据。

• 单位
  宁夏医科大学; 承德医学院; 基础医学院