结核分枝杆菌可变串联重复序列分型方法的应用

作者：冯鑫; 胡彦; 詹建; 刘文果; 朱大冕; 沈静; 张婷^*; 余锋平

来源：中国热带医学, 2023, 23(12): 1323-1328.

DOI：10.13604/j.cnki.46-1064/r.2023.12.15

• 可变串联重复序列
• 基因分型
• 近期传播率
• 潜伏感染
• 重庆

目的 通过基因分型探讨重庆市结核分枝杆菌分子流行病学特点，建立适合重庆市结核病基因分型的体系。方法 复苏培养2019—2021年重庆市丰都县、奉节县2个国家级耐药监测点结核病患者痰培养菌株268例，提取菌株DNA，采用24位点可变串联重复序列（variable number of tandem repeats, VNTR）分型方法对菌株进行基因分型，并对成簇的菌株进行流行病学调查，分析2个监测点菌株的成簇率并比较其传播差异。结果 2个地区菌株中奉节县的分辨率指数（Hunter-Gaston index, HGI）HGI指数从0到0.85,HGI 0.6以上的位点有10个；0.3≤HGI≤0.6的位点有11个；HGI<0.3的位点有3个。分辨力最高的位点为MIRU31，分辨力最低的位点为MIRU24。丰都县的HGI指数从0到0.81,HGI 0.6以上的位点有12个；0.3≤HGI≤0.6的位点有9个；HGI<0.3的位点有3个。分辨力最高的位点为MIRU26，分辨力最低的位点为MIRU23。在成簇性分析中，丰都县140例菌株中成簇的样本为10例，成簇数目为4簇，最大的1簇为4例样本，成簇率为4.1%。奉节县128例菌株中成簇的样本数为10例，成簇的数目为5簇，成簇率为4.2%。结论 重庆市丰都县、奉节县发病的主要人群为独立的基因型，近期传播率较低。患者发病主要是内源性复燃即潜伏感染者发展为活动性肺结核，防控机构在对结核病患者进行规范化管理的同时，还应加大2个监测点潜伏感染者的筛查力度，对潜伏感染者进行预防性治疗，这是降低两地结核病疫情发病率的关键。

• 单位
  重庆市结核病防治所