红笛鲷MAPKK5基因的克隆及生物信息学分析

作者：蔡佳; 黄郁葱; 吴灶和; 鲁义善; 简纪常; 冯东岳; 焦茂兴

来源：水产科学, 2015, 34(05): 288-293.

DOI：10.16378/j.cnki.1003-1111.2015.05.004

• 红笛鲷
• MAPKK5
• 基因克隆
• 生物信息学分析

利用本实验室构建红笛鲷头肾cDNA文库中的MAPKK5基因EST序列,通过RACE PCR技术克隆红笛鲷MAPKK5基因cDNA全长(Ls-MAPKK5,登录号为KM657202)。序列分析结果显示,Ls-MAPKK5cDNA全长2632bp,其中开放阅读框1317bp,可编码438个氨基酸,预测其编码蛋白的分子量为49.29ku,理论等电点为6.12。SignalP 4.0、TMHMM Server 2.0和SoftBerry-Psite预测结果显示,Ls-MAPKK5没有信号肽和跨膜结构,含有22个磷酸化位点。氨基酸序列分析显示LsMAPKK5具有保守的PB1与STKc结构域。利用MEGA5.0软件,根据邻位相连法构建MAPKK5系统进化树,结果显示Ls-MAPKK5与雀鲷、吉富罗非鱼该蛋白有较近的亲缘关系。

• 单位
  广东省教育厅; 农业部; 广东海洋大学; 宜春学院; 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室