羊种布鲁氏菌BP26蛋白的生物信息学分析

作者：赵庆亮; 卢梅^*; 谭艳; 冉光鑫; 王慧颖; 赵新霞; 盛金良^*

来源：中国病原生物学杂志, 2020, 15(11): 1277-1282.

DOI：10.13350/j.cjpb.201108

• 布鲁氏菌
• BP26蛋白
• 抗原表位
• 生物信息学分析

目的采用生物信息学方法预测羊种布鲁氏菌BP26蛋白的抗原表位。方法从NCBI数据库中获取羊布鲁氏菌的BP26蛋白的氨基酸序列,利用ExPASy蛋白分析在线软件ProtParam、SOPMA、SWISS MODEL、ProtScale、Signal 5.0、TMHMM 2.0、PSOTR,分析BP26蛋白的理化性质,二、三级结构,亲、疏水性,信号肽,跨膜区及亚细胞定位;使用IEDB分析BP26蛋白的B细胞表位;使用PROSITE SCAN分别BP26蛋白的结构域分析。结果 BP26蛋白由250个氨基酸组成,分子式为C1152H1898N328O364S12,相对分子质量为26.5×103,理论等电点为6.39,不稳定系数为27.93,为稳定蛋白。二级结构以α-螺旋为主,占41.2%;无规卷曲占36.8%,延伸链占17.2%;β-转角占4.8%。预测其三级结构与同源模板S19株BP26蛋白相似性99.55%,16个BP26分子形成一个新颖的通道状结构。BP26蛋白存在1个跨膜区,该跨膜区域位于7-29位氨基酸,可能为信号肽,与信号肽分析结果一致。Signal 5.0分析BP26蛋白在7-29位氨基酸有一个分泌型蛋白信号肽。BP26蛋白包含有14个线性表位,其中以27-42、108-125、224-240位氨基酸区段为BP26蛋白的优势抗原表位区段。BP26蛋白包含2个N-糖基化位点,2个蛋白激酶C磷酸化作用位点,2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化作用位点,5个N-豆蔻酰基化位点;亚细胞定位分析BP26蛋白为膜周质蛋白。结论生物信息学分析羊种布鲁氏菌BP26蛋白存在多个B细胞抗原表位,可以作为布鲁氏菌诊断和疫苗研究的候选抗原。

• 单位
  六盘水师范学院; 动物科技学院; 黔西南民族职业技术学院; 石河子大学