甘蔗蔗糖磷酸合成酶基因SPS IV电子克隆及生物信息学分析

作者：吴小斌; 端木卜文; 齐永文; 卢颖林; 李奇伟

来源：甘蔗糖业, 2018, (4): 1-9.

DOI：10.3969/j.issn.1005-9695.2018.04.001

• 甘蔗
• 蔗糖磷酸合成酶
• 生物信息学

蔗糖在植物生长发育过程中发挥重要作用,蔗糖磷酸合成酶(SPS)是蔗糖合成的关键酶之一.本研究以通过克隆获得的甘蔗SPS IV基因部分DNA序列为探针进行电子克隆,获得甘蔗SPS IV的编码区序列全长,并采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白的氨基酸组成、理化性质、亚细胞定位及高级结构等方面进行预测分析.结果表明:ScSPS IV基因编码区全长2943 bp,编码981个氨基酸,ScSPS IV 可能是不稳定的亲水性非分泌蛋白,主要表达于细胞质.遗传进化分析表明,该基因与高粱、玉米蔗糖磷酸合成酶基因同源性高.以上研究结果为ScSPS IV基因下一步进行分子克隆、功能验证和应用提供基础.

• 单位
  广东省生物工程研究所（广州甘蔗糖业研究所）; 仲恺农业工程学院