CADM-1对人宫颈癌Hela细胞转录组学的影响及意义

作者：刘晔; 朱宇; 周建斌^*; 杜洪灵; 胡华; 蔡骁垚; 蒋漪桦

来源：中国妇幼保健, 2023, 38(03): 516-522.

DOI：10.19829/j.zgfybj.issn.1001-4411.2023.03.034

• CADM-1
• 转录组学
• 宫颈癌

目的 探讨粘附分子CADM-1基因对人类宫颈癌细胞系Hela细胞转录组学的影响。方法 构建rLV-hCADM-1-ZsGreen-Puro慢病毒和rLV-ZsGreen-Puro对照慢病毒，将感染rLV-h CADM-1-ZsGreen-Puro慢病毒的Hela细胞作为rLV-CADM-1组，将感染rLV-ZsGreen-Puro对照慢病毒的Hela细胞作为rLV组。筛选差异基因集并进行基因转录能力、基因本体(GO)功能、京都基因与基因组数据库(KEGG)信号通路、Reactome通路及疾病本体(DO)功能分析。结果 rLV-CADM-1组CADM-1相对表达量(38.57±2.58)显著高于rLV组(0.90±1.08),差异有统计学意义(t=20.460,P<0.05)。基因差异分析共筛选出321个差异表达的基因，其中表达上调171个、表达下调150个。差异最显著的前10个表达上调基因包括OLFM1、TUSC3、ENSG00000285779、SPARC、CCL5、ENSG00000261512、CADM-1、OAS1、CLIC3及CSAG3。差异最显著的前10个表达下调基因包括COL16A1、SYTL4、ENSG00000278996、CGA、SLC47A1、TNC、ENSG00000276570、UGT3A1及MARCOL。功能分析结果显示，CADM-1改变了Hela细胞部分基因的转录能力、参与调控GO功能、KEGG信号通路、Reactome通路及DO功能。结论 CADM-1可明显影响Hela细胞的转录组学。

• 单位
  中心实验室; 上海市普陀区人民医院; 南华大学