水牛ApoB基因多态性与泌乳性状关联分析

作者：林雨昕; 曹家瑄; 孙晖; 李俊; 李华钊; 吴祺鹏; 邓廷贤; 杨利国; 滑国华

来源：基因组学与应用生物学, 2022, 41(06): 1180-1192.

DOI：10.13417/j.gab.041.001180

• 水牛
• ApoB
• 泌乳性状
• 性状关联分析
• 基因多态性

本研究旨在探究水牛(Bubalus bubalis)载脂蛋白B基因(ApoB)在地中海水牛群体中的遗传多态性，并与地中海水牛泌乳性状进行关联分析，筛选水牛产奶性状分子标记。本研究以350头地中海纯种奶水牛为研究对象，利用直接测序法和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)法筛选基因多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)与基因分型，并进一步分析单倍型与泌乳性状的相关性。结果显示，在地中海水牛群体ApoB基因中筛选到10个SNPs,分别位于启动子(g.-1718A>G、g.-1823G>C和g.-2063A>C)、第7内含子(g.8105G>A)、第26内含子(g.30643G>A)、第5外显子(g.5903G>A)、第26外显子(g.30879T>C、g.33638A>C和g.37375G>A)和第29外显子(g.40787A>G)区域。10个SNPs位点多态信息含量均大于0.25且小于0.5,属于中度多态。其中g.-1718A>G、g.-1823G>C、g.-2063A>C、g.37375G>A和g.40787A>G突变位点与地中海水牛乳蛋白率显著相关，g.5903G>A和g.40787A>G位点与地中海水牛乳脂率显著相关，g.37375G>A与地中海水牛270天乳蛋白量和乳脂量显著相关。单倍型Block1(g.-1718A>G、g.-1823G>C和g.-2063A>C)与270天乳蛋白量和乳蛋白率显著相关；单倍型Block2(g.30643G>A和g.33638A>C)与270天乳脂含量、乳脂率、270天乳蛋白量以及乳蛋白率显著相关；单倍型Block3(g.37375G>A和g.40787A>G)与乳蛋白率显著相关；g.33638A>C、g.37375G>A、g.40787A>G以及单倍型Block2和Block3突变型蛋白质理化性质和二级结构发生改变。本研究共筛选到6个SNPs和3个单倍型Block与水牛泌乳性状显著相关，其中单倍型Block2的H3H3为最优单倍型，可作为水牛产奶性状潜在分子标记。

• 单位
  中国农业科学院广西水牛研究所; 中国农业科学院深圳农业基因组研究所; 广西壮族自治区水牛研究所; 遵义医科大学; 华中农业大学; 基础医学院; 动物科技学院