强直性脊柱炎患者外周血环状RNA的表达谱研究

作者：唐乙萍; 易婷; 郑建雄; 戴菲; 董曾荣; 张全波; 青玉凤^*

来源：中华风湿病学杂志, 2021, 25(05).

• 脊柱炎, 强直性
• 微阵列分析
• 环状RNA
• 生物信息学分析

目的筛选AS患者PBMCs中差异表达的环状RNA(circRNA), 分析其表达谱以探讨circRNAs在AS发病中的作用。方法采用circRNA微阵列芯片技术检测3例AS活动期(ASA)患者, 3例AS稳定期(ASS)患者和3名健康对照者(HC)PBMCs中circRNAs的表达并通过倍数变化(FC)和P值进行筛选, 找到差异表达的circRNAs;从差异表达靠前的circRNAs中随机选择4个circRNAs, 采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证芯片结果;对差异表达的circRNAs进行基因本体论(GO)分析, 京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析, 并通过微RNA(miRNA)靶标预测软件对circRNA/miRNA相互作用关系进行预测。采用t检验和Mann-WhitneyU检验等方法对数据进行统计分析。结果芯片结果显示, ASA组较HC组共有800个显著差异表达的circRNAs(FC>1.5, P<0.05), 其中466种上调, 334种下调;ASS组较HC组共有1 149个显著差异表达的circRNAs(FC>1.5, P<0.05), 其中589种上调, 560种下调;ASA组较ASS组间共有233个显著差异表达的circRNAs(FC>1.5, P<0.05), 其中145种上调, 88种下调。RT-qPCR验证结果提示, 4个差异表达的circRNAs表达趋势与芯片结果一致。GO分析结果提示, 这些差异表达的circRNAs主要参与无义介导的mRNA衰变、Rho GTPase酶结合等过程;KEGG分析结果在辅助性T细胞(Th)17细胞分化、趋化因子信号通路等处得到富集;miRNA靶标预测软件结果提示差异表达的circRNAs可能靶向结合miR-650、let-7b-5p等miRNAs发挥作用。结论和HC组相比AS患者PBMCs中存在差异表达的circRNAs, 推测这些circRNAs可能参与AS的发病。

• 单位
  川北医学院附属医院