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摘要
【目的】建立基于16S rRNA序列和gyrB基因串联DNA特征序列的气单胞菌联合建树方法，为气单胞菌种间区分提供研究思路和依据。【方法】以2020—2021年在福建、江苏等地分离到的水产源气单胞菌和在NCBI上已完成全基因组测序的十种气单胞菌作为实验对象，分别以16S rRNA、gyrB基因和两个基因序列串联后得到的新DNA特征序列作为进化树建树依据，通过比较其不同系统发育树来鉴定结果，并以运动性实验、溶血性实验、糖发酵实验辅助确定鉴定结果。【结果】进化树结果显示，联合建树方法相比单基因建树能有更好的区分效果。单16S rRNA序列建树时在简达气单胞菌和维氏气单胞菌之间分辨力较弱，在中间气单胞菌、肠源气单胞菌、豚鼠气单胞菌和达卡气单胞菌之间分辨力也较弱；单gyrB基因建树时在简达气单胞菌和异嗜糖气单胞菌之间分辨力较弱，在嗜水气单胞菌、达卡气单胞菌和豚鼠气单胞菌之间分辨力也较弱；而在使用16S rRNA和gyrB基因串联的DNA特征序列建树时，能将各个种的气单胞菌独立聚为一支，能较好的实现种间区分。【结论】基于16S rRNA和gyrB基因串联DNA特征序列的建树方法能将气单胞菌鉴定到种，相较于单基因建树，联合建树有着更高的分辨力，是一种较好的保守序列相似度高的属内菌种鉴定方法，具有进一步深入研究的价值。
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单位上海海洋大学; 国家水生动物病原库
