云南省墨江县库蠓中一株西藏环状病毒的分离及全基因组序列分析

作者：杨振兴; 孟锦昕; 何于雯; 李楠; 王静林^*

来源：病毒学报, 2022, 38(06): 1419-1428.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004229

• 库蠓
• 病毒分离
• 西藏环状病毒
• 序列分析

西藏环状病毒（Tibet orbivirus,TIBOV）于2009年首次从中国西藏自治区采集的圆斑按蚊中分离出，目前在中国的云南省、广东省、湖南省和临国日本均有分离报道。2017年我们从云南省墨江县采集的库蠓样品中分离到一株病毒（MJC1-7），接种BHK-21和C6/36细胞后均可产生聚集、皱缩和脱落等明显细胞病变。1%的琼脂糖凝胶电泳显示，病毒基因组为十节段的双链RNA，呈现“3-3-3-1”的带型。通过病毒全长cDNA扩增和测序获取MJC1-7毒株的全基因组核苷酸序列，病毒基因组全长为19 260 bp（包括编码区18 495 bp和非编码区735 bp），由Seg-1(3 950 bp)至Seg-10(832 bp)的10个基因节段构成，可编码6 165个氨基酸残基。对环状病毒保守的VP1(Pol)、VP3(T2)和VP7(T13)蛋白氨基酸序列及系统发育分析显示，MJC1-7毒株与TIBOV亲缘关系最近，氨基酸序列相似度为95.4%～99.7%。对决定环状病毒血清型VP2(OC1)蛋白氨基酸序列与系统发育分析显示，MJC1-7与云南（SX-2017a、DH13C120和YN15-283-01）和广东（D181/2008）分离的TIBOV毒株聚为一簇，氨基酸序列相似度为97.3%～98.6%，而中国西藏毒株（XZ0906）和日本毒株（KSB-8/C/09和KSB-3/C/10）形成了另外3个独立的进化分支，MJC1-7与其相似度仅为27.8%～41.8%，以上结果表明MJC1-7毒株与云南和广东毒株有更近的亲缘关系，而中国西藏和日本毒株可能为Seg-2(OC1)基因变异较大毒株。本研究报道了一株TIBOV在我国云南省墨江县库蠓上的分离以及全基因组序列分析，研究结果进一步丰富了我们对TIBOV的认知，为深入研究我国TIBOV的分布、致病性与病原学检测技术提供了基础数据。

• 单位
  云南省畜牧兽医科学院