目前我国政府已经开始了权责发生制下政府综合财务报告体系的改革,但是从改革的现状来看,取得的成绩并不理想。文章以政府预算会计与财务会计结合下权责发生制为基础,分析其存在的问题涵盖了主体责任意识不清,政府综合财务报告系统建设滞后,制度执行不够到位等问题,针对这些问题提出了对应的策略主要有:加强编报队伍建设,进一步形成工作合力,着力做好政府会计制度的规范,夯实编制基础,进一步完善系统功能,提高政府治理效能等内容,这为权责发生制下政府综合财务报告体系的完善提供了一定的理论基础。