二代测序在Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗毒种遗传稳定性研究中的应用

作者：杨洁; 郭靖; 庞德钦; 杨安纳; 杨东升; 吴杰; 廖文博; 周以斯; 孟胜利; 王泽鋆; 申硕^*

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2022, 36(05).

• 灭活疫苗
• 毒种
• 二代测序技术
• 遗传稳定性

目的分析并监测Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗毒种遗传稳定性。方法毒种通过不同的方式, 即未经过空斑纯化的毒种和空斑纯化的毒种, 在细胞上进行连续传代后, 收获细胞培养上清提取病毒核酸, 利用二代测序进行病毒宏转录组分析, 比较不同条件下Omicron株新型冠状病毒灭活疫苗毒种的全基因组突变位点及突变频率和插入/缺失的差异。结果空斑纯化毒种连续传代后, ORF1ab和S基因序列上的高于5%的突变位点明显少于未经空斑纯化的毒种, 且在纯化毒种全基因组中未检测到插入/缺失突变。结论通过二代测序技术, 分析不同路径的毒种连续传代样本的全基因组序列, 结果表明毒种经过空斑纯化后的遗传稳定性优于未纯化毒种, 为灭活疫苗研发毒种的选育提供了科学依据。

• 单位
  武汉生物制品研究所有限责任公司