摄食不同饵料草鱼肠道菌群PCR-DGGE指纹图谱构建及分子鉴定

作者:郁二蒙; 毕香梅; 谢骏; 王广军; 余德光; 龚望宝; 王海英; 李志斐
来源:生物技术通报, 2012, (09): 179-184.
DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2012.09.021

摘要

采用免培养的16S rDNA梯度凝胶电泳技术(DGGE)对摄食不同饵料(非膨化饲料组、膨化饲料组和蚕豆组)的草鱼肠道内容物细菌分析建立指纹图谱,并对主要优势条带进行了切胶克隆和测序。PCR-DGGE指纹图谱初步分析发现,非膨化饲料组、膨化饲料组和蚕豆组分别产生了19条、16条和15条可以鉴别的条带,且均有2-3条优势菌条带;非膨化饲料组样品和蚕豆组样品的DGGE指纹图谱的相似性系数为53.6%,非膨化饲料组菌群和膨化饲料组的相似性为39.4%。对PCR-DGGE指纹图谱主要条带进一步回收、克隆和测序,结果共得到25条序列,将所得到的序列在NCBI数据库中同源性分析,发现草鱼肠道内容物细菌群落主...

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