驼血蛋白中胰脂肪酶抑制肽的计算机模拟评估

作者:伊丽*; 孙茹欣; 何静; 明亮; 张秀荣; 吉日木图
来源:天然产物研究与开发, 2023, 35(12): 2049-2060.
DOI:10.16333/j.1001-6880.2023.12.004

摘要

本研究利用中性蛋白酶对驼血蛋白进行酶解,对其酶解工艺、胰脂肪酶(PDB code:1ETH)抑制活性、多肽分子特征以及分子结合模式进行研究,以期获得高活性的胰脂肪酶抑制肽。结果表明:中性蛋白酶在酶用量为5%、酶解pH为7.0、酶解温度为55℃、酶解时间为3 h的最佳工艺条件下酶解驼血蛋白所获多肽的胰脂肪酶抑制率为42.13%。使用LC-MS/MS共鉴定出533种肽段,肽兰克评分大于0.8的有8条肽段。其中ALERMFLGF、GQPAVPVRF、WDPSKVPPR三条肽段与胰脂肪酶结合显著。通过AMBER 19进行分子动力学模拟,结果显示,三条肽段均能与胰脂肪酶活性口袋残基结合,主要通过静电作用、氢键和疏水相互作用抑制其活性。其中GQPAVPVRF结合能最高且具有更多的结合位点而成为最具潜能的胰脂肪酶抑制肽。本研究为开发新型PL抑制剂肽提供了参考,为驼血蛋白的高价值利用提供了新途径。

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