EB病毒潜伏膜蛋白LMP1疫苗的预测及验证

作者：李昆芳; 张隽宁; 丁一; 公博傲; 王然; 屈艳琳^*

来源：中国病原生物学杂志, 2023, 18(07): 750-758.

DOI：10.13350/j.cjpb.230702

• LMP1
• EB病毒
• 生物信息学分析

目的 采用生物信息学方法分析EB病毒潜伏膜蛋白LMP1,为疫苗的研发提供理论依据。方法 在NCBI数据库中获取LMP1蛋白的基因组序列和氨基酸序列，采用生物信息学分析工具ProtParam、SOPMA、SWISS MODEL、SignalP、TMHMM、Cell-PLoc 2.0、NetNGly、NetPhos-3.1、Conserved domains、IEDB、BLAST、Immunomedicine Group、UniProt预测LMP1蛋白的理化性质，二、三级结构，信号肽和跨膜区域，亚细胞定位，糖基化位点和磷酸化位点，保守结构域，B、T细胞表位，同源性，抗原决定簇以及相互作用蛋白。构建重组质粒LMP1-pMV261以及重组卡介苗，并通过检测LMP1分子及蛋白表达水平探究构建疫苗的基本条件。结果 LMP1蛋白分子式为C1901H2877N493O562S11,氨基酸数为386,相对分子质量为41.98238×103,原子总数为5 844。LMP1蛋白为稳定亲水蛋白，二级结构主要为无规则卷曲(Cc),占49.48%,易与抗体嵌合。该蛋白无信号肽，具有6个跨膜区，亚细胞定位在宿主细胞膜，无糖基化位点，有27个磷酸化位点，7个相互作用蛋白。实时荧光定量PCR及Western blot检测该蛋白基因及蛋白表达均稳定。结论 生物信息学分析LMP1蛋白为稳定亲水蛋白，含有丰富的B、T细胞表位，构建的重组卡介苗蛋白表达稳定，可作为EB病毒的候选疫苗。

• 单位
  基础医学院; 济宁医学院