肠组织长链非编码RNA表达谱在新生儿坏死性小肠结肠炎组织中的变化

作者：潘兆军; 武荣; 李玉红; 田兆方^*

来源：中南大学学报(医学版), 2020, 45(09): 1035-1043.

• 长链非编码RNA
• 新生儿坏死性小肠结肠炎
• 高通量测序

目的:长链非编码RNA(lncRNA)参与新生儿坏死性小肠结肠炎(necrotizing enterocolitis,NEC)的发生和发展,本研究探讨新生儿NEC肠组织lncRNA表达谱的变化及其潜在机制。方法:收集需要手术治疗的NEC患者肠样本11份,同期非NEC需要手术新生儿肠样本7份。采用Illumina HiSeq对6份肠样本(对照组3份,NEC组3份)进行lncRNA高通量测序,得到NEC组和对照组的lncRNA差异表达谱。剩余部分标本采用实时聚合酶链反应检测差异表达的lncRNA的相对表达量,验证高通量测序的结果。对差异表达的基因进行Gene Ontology(GO)分析和KEGG信号通路分析。结果:对照组和NEC组组间存在显著差异的lncRNA有5 257个。表达上调的NONHSAG008675.3,NONHSAG020715.2,NONHSAG038187.2以及下调的NONHSAG028744.3的验证结果与测序结果相符。NEC肠组织DUOX2,IL-6,TNF,SAA1表达上调。对表达水平有显著差异的lncRNA靶基因进行GO富集,GO富集的生物进程主要有对刺激的调节、分子黏合和功能的调节、信号网络及转录信号调节等方面。KEGG主要富集PI3K-Akt,炎症性肠病,NF-κB等。结论:LncRNAs可能参与NEC的发病机制,炎症相关的lncRNAs可能是关键影响因素之一。

• 单位
  南京医科大学; 淮安市妇幼保健院