杂交兰叶色相关转录因子生物信息学分析

作者：张晓莹; 傅巧娟; 赵福康; 李春楠; 阮若昕

来源：分子植物育种, 2021, 1-10.

• 杂交兰
• 转录因子
• 生物信息学

转录因子在转录水平上调控基因表达，广泛参与植物生长发育、器官形态建成、逆境胁迫和激素信号应答。为进一步研究杂交兰（Hybrid Cymbidium）叶色相关NAC、MYB和bHLH转录因子，本研究利用生物信息学方法对杂交兰NAC、MYB和bHLH基因编码蛋白的理化性质、分布、蛋白结构、磷酸化位点及系统进化关系进行了分析。结果表明，NAC、MYB和bHLH家族基因编码的蛋白既有酸性蛋白也有碱性蛋白，所有蛋白均为亲水性蛋白；亚细胞定位均定位在细胞核；各转录因子家族蛋白具有较高的保守性；编码蛋白序列都包含丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点。本研究为杂交兰叶色相关NAC、MYB和bHLH基因家族的功能分析奠定基础。

• 单位
  杭州市农业科学研究院