胰岛素瘤相关差异表达基因的生物信息学分析

作者：高志壕

来源：医学理论与实践, 2021, 34(15): 2562-2565.

DOI：10.19381/j.issn.1001-7585.2021.15.004

• 胰岛素瘤
• 差异表达基因
• 生物信息学

目的:应用生物信息学方法探讨胰岛素瘤患者差异表达基因(DEGs),为阐明胰岛素瘤的发病机制提供新线索。方法:从GEO数据库下载胰岛素瘤基因芯片数据集GSE73338,应用GEO在线分析工具GEO2R筛选差异表达基因。使用DAVID数据库对筛选出的差异表达基因进行功能注释(G0)和通路分析(KEGG),利用STRING和Cytoscape进行蛋白互作网络分析(PPI)。利用Cytoscape软件CytoHubb插件获得Hub基因。结果:筛选出319个DEGs,包括上调的140个和下调的179个。DEGs分子功能主要为蛋白质结合;细胞组分集中于细胞表面及细胞外隙;生物学过程主要富集于炎症反应、细胞对TNF/IL1反应、细胞增殖负调控。KEGG分析发现它们主要涉及TNF信号通路、细胞因子受体相互作用通路和NOD样受体信号通路等。IL6、CXCL8、IL1β、APP、CD44、ICAM1、VCAM1等基因被筛选为胰岛素瘤相关Hub基因。结论:通过生物信息学分析胰岛素瘤DEGs,有助于揭示胰岛素瘤发生发展的重要分子机制。