水稻蛋白质相互作用网络的预测与分析

作者：蔡浩洋; 李校; 徐加豹; 张义正

来源：四川大学学报(自然科学版), 2010, 47(06): 1417-1422.

DOI：10.3969/j.issn.0490-6756.2010.06.039

• 水稻
• 蛋白质相互作用
• 同源映射
• 蛋白质功能预测

通过同源映射的方法,利用6个模式物种的蛋白质相互作用数据预测水稻的蛋白质相互作用网络.预测到水稻中有4483个蛋白质参与了24942个蛋白质相互作用.通过GO注释,结构域相互作用,基因共表达等3个证据评估预测网络的质量,并对网络进行了拓扑属性分析.结果表明水稻的蛋白质相互作用网络符合scale-free属性.通过对网络中功能模块的分析,可以预测蛋白质的功能和亚细胞定位信息.

• 单位
  生命科学学院; 四川大学