幽门螺杆菌基因组表达谱芯片的研制

作者：韩跃华; 刘文忠; 史耀舟; 赵国屏; 萧树东; 张庆华

来源：微生物学通报, 2007, (01): 6-9.

DOI：10.13344/j.microbiol.china.2007.01.002

• 幽门螺杆菌
• 基因组
• 表达谱芯片 Helicobacter pylori
• Genome
• Expression microarray

以H．pylori 26695和J99作为模板,采用多聚酶链反应(PCR)扩增得到所需要的开放阅读框(open read- ing frame,ORF)片段。使用Genemachine点样仪进行点样,采用随机九聚体、Cy3-dCTP或Cy5-dCTP和Super- scriptⅡ标记H．Pylori RNA标本,完成芯片杂交过程(?)数据判断标准是标化后Cy3/Cy5比值(ratio)≤0．5为基因表达上调,若ratio值≥2．0则为表达下调。采用芯片重复性、信噪比评估芯片质量,应用RT-PCR反应验证芯片结果。研制的H．pylori基因组DNA芯片共包括1636个ORF,其中H．pylori...

• 单位
  浙江大学医学院附属第二医院; 上海交通大学医学院附属仁济医院; 生物芯片上海国家工程研究中心