胰腺癌及癌旁组织中提取RNA样品的方法优化及鉴定

作者:魏伟; 欧政林; 窦晓淋; 唐翎*
来源:现代生物医学进展, 2022, 22(20): 3813-3817.
DOI:10.13241/j.cnki.pmb.2022.20.003

摘要

目的:优化胰腺癌及癌旁组织总RNA的提取方法,为胰腺相关疾病的发病机制研究提供高质量的实验样本。方法:采用组织块分离剪碎、RNase清洗及抑制等方法对胰腺癌及癌旁组织进行预处理,液氮研磨及trizol-氯仿抽提的方法提取组织RNA。通过琼脂糖凝胶电泳及生物分析仪鉴定RNA的完整性。使用等量RNA作为逆转录模板,以oligo dT引物对信使RNA(message RNA, m RNA)进行逆转录;以茎环结构引物对微小RNA(microRNA, mi RNA)进行逆转录。通过定量PCR的方法检测m RNA及mi RNA的表达水平。结果:相较于常规方法,优化方法提取的RNA样品降解程度低,完整性较高。相对于胰腺癌组织,癌旁组织RNA更易降解,m RNA的表达水平出现降低趋势;但mi RNA的表达在胰腺癌及癌旁组织中无明显差异。结论:胰腺癌及癌旁组织的预处理可降低RNA降低程度,可为RNA的表达检测提供高质量的实验样本,增加实验准确度。

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