本发明公开了一种基于PCA和TSSM模型的膈肌预测系统及方法,其实现的思路是:将4DCT扫描获取的呼吸时相数据重建成每个相位的人体三维图像;从人体三维图像中分割出膈肌图像,计算膈肌位移;从人体三维图像中分割出胸腹表面图像,计算胸腹表面位移;对膈肌位移和胸腹表面位移分别进行主成分分析,使其降维并映射到各自的d维子空间中;利用岭回归优化计算出从d维子空间的胸腹表面位移映射到d维子空间的膈肌位移的变换矩阵。本发明具有对患者的伤害更少,选取的膈肌质心更加准确,抗干扰性更好的优点。